Informace o projektu
Genomová variabilita treponem během experimentální infekce

Informace

Projekt nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Lékařskou fakultu. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.

Kód projektu

GP14-29596P

Období řešení

1/2014 - 12/2016

Investor / Programový rámec / typ projektu

Grantová agentura ČR

Postdoktorské projekty

Fakulta / Pracoviště MU

Lékařská fakulta

Mgr. Michal Strouhal, Ph.D.

Rod Treponema zahrnuje bakteriální druhy a poddruhy, které jsou obligátními patogeny lidí a zvířat a pro které je charakteristická různá míra patogenity a hostitelské specifity a obecná nemožnost jejich kultivace za podmínek in vitro. Pro tyto bakterie je charakteristická také schopnost uniknout imunitnímu systému příslušného hostitele a tato schopnost je dávána do souvislosti s genomovou variabilitou příslušného treponemálního kmene. Detekce variabilních míst na úrovni příslušného treponemálního kmene tak může vést k většímu porozumění mechanizmů patogeneze treponemálních onemocnění. V této práci navrhujeme identifikovat variabilní úseky v genomech vybraných treponemálních kmenů na základě in silico analýzy dostupných sekvenačních dat, dále charakterizovat vnitrokmenovou variabilitu syfilitického kmene DAL-1 v průběhu experimentální infekce v králíkovi a na základě toho identifikovat genetickou variabilitu v treponemální DNA izolované z lidského klinického materiálu.

Publikace

Počet publikací: 6

2019

Identification of positively selected genes in human pathogenic treponemes: Syphilis-, yaws-, and bejel-causing strains differ in sets of genes showing adaptive evolution

MADERANKOVA Denisa MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal VADJAK Simon KUKLOVA Ivana POSPÍŠILOVÁ Petra KRBKOVÁ Lenka KOSCOVA Pavlina PROVAZNIK Ivo ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

PLoS neglected tropical diseases, rok: 2019, ročník: 13, vydání: 6, DOI

2017

Human Treponema pallidum 11q/j isolate belongs to subsp. endemicum but contains two loci with a sequence in TP0548 and TP0488 similar to subsp. pertenue and subsp. pallidum, respectively

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal OPPELT Jan GRANGE Philippe Alain JANIER Michel BENHADDOU Nadjet DUPIN Nicolas ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

PLoS neglected tropical diseases, rok: 2017, ročník: 11, vydání: 3, DOI
Molecular Typing of Syphilis-Causing Strains Among Human Immunodeficiency Virus-Positive Patients in Antwerp, Belgium

MIKALOVÁ Lenka GRILLOVÁ Linda OSBAK Kara STROUHAL Michal KENYON Chris CRUCITTI Tania ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

Sexually Transmitted Diseases, rok: 2017, ročník: 44, vydání: 6, DOI

2016

Characterizing the Syphilis-Causing Treponema pallidum ssp pallidum Proteome Using Complementary Mass Spectrometry

OSBAK Kara K. HOUSTON Simon LITHGOW Karen V. MEEHAN Conor J. STROUHAL Michal ŠMAJS David CAMERON Caroline E. OSTADE Xaveer Van KENYON Chris R. RAEMDONCK Geert A. Van

Článek v odborném periodiku

PLoS neglected tropical diseases, rok: 2016, ročník: 10, vydání: 9, DOI
Treponema pallidum 11qj Subtype May Correspond to a Treponema pallidum Subsp Endemicum Strain

GRANGE Philippe Alain MIKALOVÁ Lenka GAUDIN Cyrill STROUHAL Michal JANIER Michel BENHADDOU Nadjet ŠMAJS David DUPIN Nicolas

Článek v odborném periodiku

Sexually transmitted diseases, rok: 2016, ročník: 43, vydání: 8

2015

A Retrospective Study on Genetic Heterogeneity within Treponema Strains: Subpopulations Are Genetically Distinct in a Limited Number of Positions

ČEJKOVÁ Darina STROUHAL Michal NORRIS Steven J. WEINSTOCK George M. ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

PLoS Neglected Tropical Diseases, rok: 2015, ročník: 9, vydání: 10, DOI