Informace o projektu
Biomolekulární centrum
- Kód projektu
- LC06030
- Období řešení
- 3/2006 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Centra základního výzkumu
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Klíčová slova
- léčiva proti rakovině, biosenzory, lektiny, počítačové modelování biomolekul, biomolekulární NMR
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Ivan Rychlík, Ph.D.
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Výsledky
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Publikace
Počet publikací: 284
2011
-
Thermodynamics behind CV-IIL binding of saccharides
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
Three-Dimensional Potential Energy Surface of Selected Carbohydrates' CH/p Dispersion Interactions Calculated by High-Level Quantum Mechanical Methods
Chemistry - A European Journal, rok: 2011, ročník: 17, vydání: 20, DOI
-
Validation of relativistic DFT approaches to the calculation of NMR chemical shifts in square-planar Pt2+ and Au3+ complexes
Journal of Chemical Theory and Computation, rok: 2011, ročník: 7, vydání: 12, DOI
-
Virtual screening and in silico design of novel inhibitors of bacterial lectins
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
2010
-
13C Chemical Shift Tensors in Hypoxanthine and 6-Mercaptopurine : Effects of Substitution, Tautomerism, and Intermolecular Interactions
The Journal of Physical Chemistry A, rok: 2010, ročník: 114, vydání: 4, DOI
-
A TNF-like Trimeric Lectin Domain from Burkholderia cenocepacia with Specificity for Fucosylated Human Histo-Blood Group Antigens
Structure, rok: 2010, ročník: 18, vydání: 1, DOI
-
An RNA Molecular Switch: Intrinsic Flexibility of 23S rRNA Helices 40 and 68 5 '-UAA/5 '-GAN Internal Loops Studied by Molecular Dynamics Methods
Journal of Chemical Theory and Computation, rok: 2010, ročník: 2010, vydání: 6
-
ANALYSIS OF BACKBONE MOTIONS OF DELTA SUBUNIT OF RNA POLYMERASE FROM BACILLUS SUBTILIS
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Aspergillus fumigatus as a pathogen - role of surface interacting molecules
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Aspergillus fumigatus lectins - how to stay in touch
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty