Informace o projektu
Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
- Kód projektu
- MSM 143300002
- Období řešení
- 1/1999 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- image analysis; image processing; segmentation; preprocessing; deconvolution; 3D analysis; 3D reconstruction; mathematical morphology; parallel computing; parallel algorithms; optical microscopy; confocal microscopy; automation; automated microscopy
Cíl: Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi. Návrh předpokládá jak pokračování v běžícím výzkumu struktury buněčného jádra s klinickým uplatněním při diagnostice a prevenci leukémií a jiných nádorových onemocnění, tak rozšíření výzkumu na jiné aplikace počítačové analýzy mikroskopického obrazu, biomedicínské i průmyslové. Obsah: Zkoumány budou zejména algoritmy předzpracování a segmentace obrazu s důrazem na dekonvoluci 3D obrazu, na operace matematické morfologie a na 3D rekonstrukci obrazu ze série 2D obrazových řezů. Intenzivní výzkum bude veden také v oblasti paralelních algoritmů analýzy obrazu a paralelizace vybraných algoritmů na víceprocesorových pracovních stanicích s využitím vybavení Superpočítačového centra MU.Vzhledem ke značné interdisciplinárnosti,bude udržována těsná spolupráce s kolegy ze špičkových pracovišť v Oxfordu,Heidelbergu a dalších míst.
Výsledky
Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi.
Publikace
Počet publikací: 88
2001
-
Deterministic modeling of the chromatin organization in human cell nuclei
Shaping future with simulation, rok: 2001
-
Exchange aberrations among 11 chromosomes of human lymphocytes induced by gamma-rays
International Journal of Radiation Biology, rok: 2001, ročník: 77, vydání: 4
-
FISH Imaging
Confocal and two-photon microscopy: Foundations, applications, and advances, rok: 2001, počet stran: 41 s.
-
Spatial distribution of selected genetic loci in nuclei of human leukemia cells after irradiation
Radiation Research, rok: 2001, ročník: 155, vydání: 2
-
Spherical Object Reconstruction Using Star-Shaped Simplex Meshes
Energy Minimization Methods in Computer Vision and Pattern Recognition, rok: 2001
-
Struktura chromatinu vyššího řádu v interfázních jádrech buněk lidské krve
Rok: 2001, počet stran: 113 s.
-
Theoretical versus experimental resolution in optical microscopy
Microscopy research and technique, rok: 2001, ročník: 53, vydání: 2, DOI
-
Využití počítačové analýzy obrazu v moderní cytometrii
Rok: 2001, druh: Konferenční abstrakty
-
Způsob stanovení vlastností buněk metodou cytometrie s vysokým rozlišením a zařízení pro jeho provádění
Vydavatel: Úřad průmyslového vlastnictví ČR, stát vydání: Česká republika, číslo patentu: 288693, rok: 2001
2000
-
Advances in high-resolution cytometry of FISH dots in interphase cell nuclei
Rok: 2000, druh: Konferenční abstrakty