Informace o projektu
Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
- Kód projektu
- MSM 143300002
- Období řešení
- 1/1999 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- image analysis; image processing; segmentation; preprocessing; deconvolution; 3D analysis; 3D reconstruction; mathematical morphology; parallel computing; parallel algorithms; optical microscopy; confocal microscopy; automation; automated microscopy
Cíl: Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi. Návrh předpokládá jak pokračování v běžícím výzkumu struktury buněčného jádra s klinickým uplatněním při diagnostice a prevenci leukémií a jiných nádorových onemocnění, tak rozšíření výzkumu na jiné aplikace počítačové analýzy mikroskopického obrazu, biomedicínské i průmyslové. Obsah: Zkoumány budou zejména algoritmy předzpracování a segmentace obrazu s důrazem na dekonvoluci 3D obrazu, na operace matematické morfologie a na 3D rekonstrukci obrazu ze série 2D obrazových řezů. Intenzivní výzkum bude veden také v oblasti paralelních algoritmů analýzy obrazu a paralelizace vybraných algoritmů na víceprocesorových pracovních stanicích s využitím vybavení Superpočítačového centra MU.Vzhledem ke značné interdisciplinárnosti,bude udržována těsná spolupráce s kolegy ze špičkových pracovišť v Oxfordu,Heidelbergu a dalších míst.
Výsledky
Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi.
Publikace
Počet publikací: 88
2000
-
An efficient algorithm for measurement and correction of chromatic aberrations in fluorescence microscopy
Journal of Microscopy, rok: 2000, ročník: 200, vydání: 3
-
Chromosomes participating in translocations typical of malignant haemoblastoses are also involved in frequent interchanges induced by densely ionising radiation
Rok: 2000, druh: Konferenční abstrakty
-
Influence of cell fixation on chromatin topography
Analytical Biochemistry, rok: 2000, ročník: 282, vydání: 1
-
Nuclear topography of the c-myc gene in human leukemic cells
Gene, rok: 2000, ročník: 244, vydání: 1
-
Spatial arrangement of genes, centromeres and chromosomes in human blood cell nuclei and its changes during the cell cycle, differentiation and after irradiation
Chromosome Research, rok: 2000, ročník: 8, vydání: 6
-
The influence of the cell cycle, differentiation and irradiation on the nuclear location of the ABL, BCR and C-MYC genes in human leukemic cells
Leukemia Research, rok: 2000, ročník: 24, vydání: 3
-
Topography of genetic loci in tissue samples: towards new diagnostic tool using interphase FISH and high-resolution image analysis techniques
Analytical Cellular Pathology, rok: 2000, ročník: 20, vydání: 4
1999
-
Aberrations induced in chromosome 1, 2 and Y of human lymphocytes by three types of radiation of different LET value as detected by FISH
Fundamentals for the assesment of risks from environmental radiation, rok: 1999
-
Advances in computer analysis of radiation-induced changes in human genome
Fundamentals for the assesment of risks from environmental radiation, rok: 1999
-
High-resolution cytometry of FISH dots in interphase cell nuclei
Cytometry, rok: 1999, ročník: 36, vydání: 4