Informace o projektu
Specifické iontové efekty pro proteiny v roztocích a podobné biologicky relevantní systémy
- Kód projektu
- GA203/08/0114
- Období řešení
- 1/2008 - 12/2012
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
- Klíčová slova
- ionty solí, enzymatické reakce, membrány, molekulová dynamika, fluorescenční spektroskopie
- Spolupracující organizace
-
Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. Martin Hof, Dr.
- Odpovědná osoba Doc. Mgr. Pavel Jungwirth, CSc.
- Odpovědná osoba Doc. RNDr. Rüdiger Ettrich, Ph.D.
Mechanismus hydratace iontů a interakce iontů s biomolekulami hrají důležitou roli v mnoha přírodních a biotechnologických procesech. V rámci tohoto projektu plánujeme kombinovat výpočetní a experimentální nástroje s cílem dojít k základnímu porozumění těchto interakcí na molekulové úrovni. Soustředíme se na iontově specifické interakce s proteiny ve vodných a nevodných roztocích a na lipidových membránách. Pečlivě naplánované simulace molekulové dynamiky a expeerimenty nám vposledu dovolí formulovat obecná pravidla, řídící interakce biologicky relevantních iontů se solvatovanými proteiny a membránami, a racionalizovat iontové efekty na aktivitu enzymů.
Publikace
Počet publikací: 37
2010
-
Effect of organic solvents on structure and function of haloalkane dehalogenases
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
How do organic solvents affecthaloalkane dehalogenases of haloalkane dehalogenases?
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
Characterization of novel haloalkane dehalogenase DhcA from extremophilic microorganism Hahella chejuensis KCTC 2396
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
Investigation of Ligand Passage in Proteins Investigation of Ligand Passage in Proteins
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
Protein Engineering of Biocatalysts
Rok: 2010, druh: Vyžádané přednášky
-
Systems biology at work
Current Opinion in Biotechnology, rok: 2010, ročník: 21, vydání: 21
2009
-
.: Keyhole-Lock-Key Model: Engineering of Tunnels in Proteins with Buried Active Sites
Rok: 2009, druh: Vyžádané přednášky
-
Computational Tools for Designing and Engineering Biocatalysts.
CURRENT OPINION IN BIOLOGICAL CHEMISTRY, rok: 2009, ročník: 1, vydání: 13
-
Computer-Assisted Engineering of Biomolecules
Rok: 2009, druh: Vyžádané přednášky
-
Editorial: Protein Design and Engineering for Biocatalysis.
BIOTECHNOLOGY JOURNAL, rok: 2009, ročník: 2009, vydání: 4