Informace o projektu
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
- Kód projektu
- NV19-08-00250
- Období řešení
- 5/2019 - 12/2023
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu a vývoje na léta 2015 - 2022
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
- Mgr. Pavla Bouchalová, Ph.D.
- Mgr. Lucia Janáčová, Ph.D.
- Mgr. Petr Lapčík, Ph.D.
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Plzeň
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Milan Hora, Ph.D., MBA
- Odpovědná osoba MUDr. Ondřej Fiala, Ph.D.
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Alexandr Poprach, Ph.D.
- Odpovědná osoba MUDr. Alice Hlobilková, Ph.D.
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Radek Lakomý, Ph.D.
- Odpovědná osoba MUDr. Ján Podhorec
Renální karcinom (RCC) přestavuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově nejvyšší incidencí v České republice, přičemž spolehlivé molekulární prognostické a prediktivní biomarkery nejsou dosud k dispozici. Pro jejich “high-throughput“ vyhledávání a validaci zavedeme novou metodiku digitálního biobankingu založenou na získávání proteinových fingerprintů (proteotypů) pomocí hmotnostní spektrometrie v tzv. “data independent acquisition” módu. S využitím nově zavedené techniky budou analyzovány dva velmi dobře charakterizované soubory nádorů, získaná data budou statisticky hodnocena s cílem nalézt: (i) proteinové biomarkery identifikující pacienty s lokalizovaným RCC avšak s vyšším rizikem, kteří by měli být detailněji sledováni, a (ii) proteinové biomarkery související se špatnou odpovědí metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory v první linii. Očekáváme, že nalezené patterny, potenciální biomarkery, resp. potenciální terapeutické cíle pomohou přispět k zefektivnění terapie pacientů s nádory ledvin.
Publikace
Počet publikací: 28
2020
-
Outcomes According to MSKCC Risk Score with Focus on the Intermediate-Risk Group in Metastatic Renal Cell Carcinoma Patients Treated with First-Line Sunitinib: A Retrospective Analysis of 2390 Patients
Cancers, rok: 2020, ročník: 12, vydání: 4, DOI
-
Rola katechol-O-metyltransferázy u estrogén-receptor pozitívnych nádorov prsníka
Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty
-
SWATH-MS Analysis of FFPE Tissues Identifies Stathmin as a Potential Marker of Endometrial Cancer in Patients Exposed to Tamoxifen
Journal of Proteome Research, rok: 2020, ročník: 19, vydání: 7, DOI
-
Transgelin contributes to a poor response of metastatic renal cell carcinoma to sunitinib treatment
Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty
-
Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory
Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty
-
Transgelin Silencing Induces Different Processes in Different Breast Cancer Cell Lines
Proteomics, rok: 2020, ročník: 20, vydání: 7, DOI
2019
-
DDA, DIA, či directDIA: závisle, s knihovnou či bez? Praktické porovnání přístupů pro různé typy proteomických experimentů
Rok: 2019, druh: Další prezentace na konferencích
-
SWATH-MS identifikácia calcyphosinu a stathminu-1 ako markerov agresivity nádorov endometria s odlišnou špecifitou
Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty