Informace o projektu
Pokročilé sekvenační metody pro analýzu strukturních přestaveb nádorového genomu
- Kód projektu
- NU21-08-00237
- Období řešení
- 5/2021 - 12/2025
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
- Podprogram 1 - standardní
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Brno
Moderní metody sekvenování DNA umožňují podrobné mapování nádorového genomu a identifikaci lézí, na něž je možné cílit protinádorovou léčbu. Sekvenování pomocí dlouhého čtení dovoluje charakterizovat přestavby genomu, které je obtížné přesně určit pomocí standardních metod nádorové cytogenetiky. Ve skupině pacientů s hematoonkologickými diagnózami chceme využít nové sekvenační metody pro zjištění organizace genomu a rekurentních přestaveb s cílem pochopit mechanismy vzniku aberací a určit jejich význam pro klinický průběh nemoci a odpověď na léčbu.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 42
2023
-
CLLue: Searching for connections among clinical, biological, and molecular features in the dataset of leukemia patients.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Clonal competition and disrupted molecular processes in chronic lymphocytic leukemia.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Exploring patterns in clinical, biological, and molecular data of leukemia patients with CLLue.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Chromatin conformation analysis reveals genome structural and functional complexity in chronic lymphocytic leukemia.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Resolving chromatin organization in chronic lymphocytic leukemia.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Solving complex karyotypes in leukemia samples using long-read sequencing.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Web-based bioinformatic tool LYNX: LYmphoid NeXt-generation sequencing data analysis and visualization in hematological malignancies.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
2022
-
CLLue: an interactive bioinformatic tool for data exploration, segregation, and important variables selection.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Cytogenetics in Chronic Lymphocytic Leukemia: ERIC Perspectives and Recommendations
HemaSphere, rok: 2022, ročník: 6, vydání: 4, DOI
-
Distinct p53 phosphorylation patterns in chronic lymphocytic leukemia patients are reflected in circumjacent pathways activation upon DNA damage
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty