Informace o projektu
Pokročilé sekvenační metody pro analýzu strukturních přestaveb nádorového genomu
- Kód projektu
- NU21-08-00237
- Období řešení
- 5/2021 - 12/2025
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
- Podprogram 1 - standardní
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Brno
Moderní metody sekvenování DNA umožňují podrobné mapování nádorového genomu a identifikaci lézí, na něž je možné cílit protinádorovou léčbu. Sekvenování pomocí dlouhého čtení dovoluje charakterizovat přestavby genomu, které je obtížné přesně určit pomocí standardních metod nádorové cytogenetiky. Ve skupině pacientů s hematoonkologickými diagnózami chceme využít nové sekvenační metody pro zjištění organizace genomu a rekurentních přestaveb s cílem pochopit mechanismy vzniku aberací a určit jejich význam pro klinický průběh nemoci a odpověď na léčbu.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 42
2022
-
Distinct p53 phospohrylation patterns in chronic lymphocytic leukemia patients are reflected in circumjacent pathways activation upon DNA damage.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Driver genes for chronic lymphocytic leukemia can be affected not only by mutations but also by complex genomic rearrangements.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Duplication of 8q24 in Chronic Lymphocytic Leukemia: Cytogenetic and Molecular Biologic Analysis of MYC Aberrations
Frontiers in Oncology, rok: 2022, ročník: 12, vydání: June 2022, DOI
-
Evolution of TP53 abnormalities during CLL disease course is associated with telomere length changes
BMC Cancer, rok: 2022, ročník: 22, vydání: 1, DOI
-
Exploring clonal evolution in CLL: Analysis by whole exome sequencing.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Exploring different aspects of clonal evolution in chronic lymphocytic leukemia.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
In-frame deletions and insertions in the TP53 gene identified in leukemia patients result in p53 protein inactivation.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Long-read whole genomes sequencing used to detect complex chromosomal rearrangements
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
LYNX: A web-based bioinformatic tool for targeted next-generation sequencing data analysis and visualization in lymphoid malignancies.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
-
Pathogenic germline variants of TP53 gene are rare in patients with chronic lymphocytic leukemia.
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty