Informace o projektu
Včasná diagnostika leukémií užitím technologie DNA-mikročipů a sledováním epigenetických změn
- Kód projektu
- GP301/04/P136
- Období řešení
- 1/2004 - 12/2006
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Postdoktorské projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- DNA-mikročipy, leukémie, epigenetická regulace, struktura chromatinu
Pomocí technologie DNA-mikročipů budou stanoveny expresní mapy v buňkách kostní dřeně či imobilizované krve pacientů s různými typy leukémií, v různých stadiích vývoje a porovnány s daty získanými z buněk nepostižených kancerogenezí. Rozdíly zjištěné porovnáním expresních map ve zdravých a nádorových buňkách v různém stupni progrese a diferenciace nám umožní identifikovat primární, již známé, ale i nové geny, jejichž chybná funkce přispívá k rozvinutí choroby. Dále by mělo být zjištěno, jak se změna aktivity těchto genů odráží v aktivitě dalších známých a i neznámých genů a jaká je lokalizace těchto genů na odpovídajících chromosomech. Pro korelování míry exprese a epigenetických změn bude použita FISH a cytometrie s vysokým rozlišením. Strukturálním-epigenetickým- studiím budou podrobeny chromosomy s pozměněnou mírou exprese. Změny ve struktuře chromatinu buněk pacientů s leukémií v různých stadiích onemocnění oproti kancerogenezí nepostiženým buňkám budou porovnány se změnami exprese.
Výsledky
Projekt přispěje k celosvětovému úsilí o vyřešení problému karcinogeneze.
Publikace
Počet publikací: 13
2005
-
Sledování změn genové exprese u pacientů s kolorektálním karcinomem pomocí cDNA microarrays technologie a jejich diagnostika pomocí transkripčních map
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty
-
Transcriptional profiling of human CD34+ cells during in vitro differentiation
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty
2004
-
Clustering of genes with similar regulation patterns during monocyte and granulocyte differentiation of HL-60 cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004